El discurso expositivo del Museo Arqueológico Nacional se divide en siete ámbitos principales distribuidos en los 600 metros cuadrados que ocupa la muestra:
1. Un mundo en guerra. Europa y América hacia 1800
2. La última misión de la fragata Mercedes
3. Combate en el cabo de Santa María y hundimiento de la Mercedes
4. Tras el combate: la Mercedes, casus belli
5. Arqueología frente a expolio
6. La carga. Caudales y otras mercancías.
7. Un proceso judicial en defensa del Patrimonio Cultural Subacuático. La batalla en los tribunales
Arquia, el Museo de Arqueología Submarina de Cartagena, dependiente del citado Ministerio, expone y custodia el gran tesoro de la Fragata Mercedes, que fue hundida por los ingleses en 1904, pese a la tregua bélica establecida en Europa.
La fragata Mercedes emprendió travesía desde Montevideo a Cádiz junto a las fragatas Medea, Fama y Clara. Cada una de ella llevaba más de medio millñon de monedas de oro y plata, que en el caso de La Mercedes se hundió en el océano y en las otras fue expoliado por el Gobierno de Inglaterra.